Taller de secuenciación y análisis de datos de microbiomas usando el equipo MiSeq de Illumina
Para dicho taller estaremos generando librerías del gen 16S (región V3-V4) con la metodología 16S Metagenomics de Illumina y secuenciándolas en el equipo MiSeq del CIBCM. Instructores: Sarah Craig – Penn State University, Daniel Blankenberg – Cleveland Clinic Lerner Research Institute. Posteriormente, en el taller de Análisis de Datos se usará la plataforma Galaxy y el command line para hacer la clasificación taxonómica de un ejemplo de comunidad microbiana.
Instructores: Sarah Craig (Pennsylvania State University), Daniel Blankenberg (Cleveland Clinic)
Fecha: 8 al 12 de enero 2018
rebeca.campos@ucr.ac.cr
Nivel de dificultad media.
Inglés
Archivos
| Nombre del archivo | Descripción | Enlace |
|---|---|---|
| Capacitación_R.Rmd | Script del 18 de agosto 2017 que cubre los aspectos básicos de R (variables, vectores, matrices, factores). | Descargar archivo |
| Capacitación_R_2.Rmd | Script del 25 de agost del 2017 que cubre los temas dataframes, lists, regresión lineal). | Descargar archivo |
| Ejercicios_1.R | Ejercicios para practicar. | Descargar archivo |