Servicios de diagnóstico de fitopatógenos brindados por el LaFOV
El LaFOV cuenta con experiencia e infraestructura para la prestación de servicio de diagnóstico de fitopatógenos a través de distintas técnicas. La aplicación de cada una dependerá del fitopatógeno en cuestión, el nivel de especificidad en la identificación y el presupuesto. Nuestros análisis y costos incluyen controles positivos y negativos.
Para coordinar el servicio contáctenos:
Tels: 2511-2315 / 2511-2313
Email: lafov.cibcm@ucr.ac.cr
Realizamos pruebas serológicas (ELISA) o moleculares para la detección de:
- virus (especies o grupos de virus)
- viroides
- fitoplasmas
- Xylella fastidosa
- “Ca. Liberibacter asiaticus” (HLB o Huanglongbin)
**No contamos con una prueba para detección general de virus. Es decir, con un solo análisis no podemos decir si una muestra tiene en general algún virus o no. Lo que podemos hacer es evaluar muestras para la presencia de un virus o grupo viral en particular; y concluir si se detecta o no una especie o grupo viral en particular.
Abreviaciones utilizadas:
PCR: reacción en cadena de la polimerasa. Existen variantes como punto final (“end-point”), anidado (“nested”) o en tiempo real (“real-time”).
RT-PCR: reacción de retrotranscripción (RT) seguida de reacción en cadena de la polimerasa (PCR).
LAMP: amplificación isotérmica mediada por bucle.
ELISA: acrónimo en inglés para ensayo de inmunoabsorción ligado a enzima (identificación específica de una especie de virus o un grupo (potyvirus) mediante el uso de anticuerpos específicos, serología).
Detección mediante técnicas moleculares:
Costos:
| Técnica | Precio unitario | Mínimo de muestras | Patógenos a detectar |
|---|---|---|---|
| LAMP | $28 + 2%IVA | 4 | Fitoplasmas, Xylella |
| RT-PCR tiempo real | $25 + 2%IVA | 2 | HLB |
| PCR punto final | $ 45 + 2%IVA | 2 | Xylella, Papaya BunchyTop |
| PCR nested | $50 + 2%IVA | 2 | Fitoplasmas |
| RT-PCR punto final con 1 par de primers | $60 + 2%IVA | 2 | *Virus/Viroides* |
| RT-PCR 2 pares de primers | $100 + 2%IVA | 2 | ToBRFV, Nepovirus, Torradovirus |
| RT-PCR 3 pares de primers | $140 + 2%IVA | 2 | PWMaV I II y III |
Lista de patógenos identificados por métodos moleculares:
| Fitopatógeno | Método de detección |
|---|---|
| Candidatus Liberibacter asiaticus-CLas | LAMP y PCR tiempo real |
| Fitoplasmas (general) | LAMP o PCR Nested |
| Nepovirus (genero viral, se detectan varias especies). | RT-PCR 2 pares primers |
| Papaya bunchy top -PBT | PCR Punto Final |
| Potexvirus (género viral, muchas especies). | RT-PCR |
| Rhabdovirus (género viral, muchas especies). | RT-PCR |
| Tobamovirus (género viral, muchas especies). | RT-PCR |
| Tomato brown rugose fruit virus-ToBRFV | RT-PCR 2 pares |
| Torradovirus (género viral, muchas especies) | RT-PCR 2 pares |
| Umbravirus (género viral, muchas especies) | RT-PCR |
| Viroides (Pospiviroides) | RT-PCR |
| Xylella fastidiosa | LAMP (o ELISA) |
Detección mediante técnicas serológicas (ELISA):
El costo por muestra incluye un análisis por duplicado (dos pozos) para mayor seguridad del resultado. Y por cada análisis también se corren controles certificados negativos y positivos.
Costos:
| Técnica | Precio unitario | Mínimo de muestras |
|---|---|---|
| Elisa virus | $112 el análisis de 4 muestras, $10 extra por muestra | 4 |
| Elisa Xylella fastidiosa | $140 el análisis de 4 muestras, $14 extra por muestra | 4 |
Lista de patógenos identificados por serología (ELISA):
| Virus | Acrónimo | Clasificación |
|---|---|---|
| Alfalfa mosaic virus | AMV | Alfamovirus |
| Arabis mosaic virus | ArMV | Nepovirus |
| Banana streak virus | BSV (BSOLV) | Badnavirus |
| Banana bract mosaic virus | BBrMV | Potyvirus |
| Banana bunchy top virus | BBTV | Babuvirus |
| Citrus tristeza virus | CTV | Closterovirus |
| Cucumber mosaic virus | CMV | Cucumovirus |
| Cymbidium mosaic virus | CymMV | Potexvirus (Mandarivirus) |
| Dasheen mosaic virus | DsMV | Potyvirus |
| Impatiens necrotic spot virus | INSV | Tospovirus |
| Iris yellow spot virus | IYSV | Tospovirus |
| Potato virus Y | PVY | Potyvirus |
| Tomato mosaic virus | ToMV | Tobamovirus |
| Potyvirus | Poty | Potyvirus |
| Papaya ringspot virus | PRSV | Potyvirus |
| Pepino mosaic virus | PePMV | Potexvirus (Mandarivirus) |
| Pepper mild mottle virus | PMMoV | Tobamovirus |
| Tomato aspermy virus | TAV | Cucumovirus |
| Tobacco etch virus | TEV | Potyvirus |
| Tobacco mosaic virus | TMV | Tobamovirus |
| Tobacco rattle virus | TRV | Tobravirus |
| Tomato ringspot virus | ToRSV | Nepovirus |
| Tobacco ring spot virus | TRSV | Nepovirus |
| Tomato bunshy stunt virus | TBSV | Tombusvirus |
| Papaya mosaic virus | PapMV | Potexvirus |
| Tobacco streak virus | TSV | Ilarvirus |
| Tomato spotted wilt virus | TSWV | Tospovirus |
*** Para la detección de otros virus consulte disponibilidad de reactivos con nosotros.
Cómo debe entregarse la muestra:
Las muestras vegetales (hojas, flores, frutos, raíces) deben venir envueltas en papel toalla húmedo y dentro de una bolsa plástica debidamente identificada (códigos, número de planta…);
En el caso de semillas, se requiere un mínimo de 50 para germinar.
En el caso de insectos, estos deben venir en alcohol de 95%, debidamente identificados y de preferencia mantenerse en frío.
Nota: si no entrega el mínimo de muestra requerido para el análisis, se realizarán réplicas del mismo material entregado para completar el mínimo de muestras requeridas según corresponda.
Por favor, contactar al laboratorio si tiene dudas sobre cómo tomar la muestra.
Duración de análisis:
Los resultados se entregan dentro de 7 días laborables posteriores a la recepción de la muestra en el laboratorio.
Horario de atención:
Lunes a Viernes 8:30am – 4:30pm
Contactenos:
Teléfonos: 2511-2315 / 2511-2313
Email: lafov.cibcm@ucr.ac.cr
Dirección:
CIBCM: https://goo.gl/maps/oK2dqyvv2p8ydvL3A
Ingreso por entrada vehícular principal de la Ciudad de la Investigación detrás del Colegio Calasanz https://goo.gl/maps/P2pDfAzngCnkpkCG7
Documentos :
Información de números de cuenta para pagos
Formulario para solicitud de análisis
Formulario para solicitud de cotización