NGS analysis applied to virome sequencing in agricultural systems
En este curso se enseñó cómo planear y diseñar experimentos para secuenciar viromas en cualquier organismo de interés. Así como su aplicación en la detección de enfermedades agrícolas, descubrimiento de agentes de control biológico, estudios de biodiversidad y el fitobioma de las plantas. Además se implementaron flujos de análisis de viromas y su interpretación, junto al uso de bases de datos para genómica viral.
Instructores: Segundo Fuentes (CIP, Perú), Ana Pérez Rodas (CIP, Perú), Jan Kreuze (CIP, Perú), Ricardo Alcalá (Universidad de Florida), Rebeca Campos, Andrés Gatica
Fecha: 2 al 4 de marzo 2020
rebeca.campos@ucr.ac.cr
Nivel de dificultad alta.
Español
Archivos
| Nombre del archivo | Descripción | Enlace |
|---|---|---|
| Capacitación_R.Rmd | Script del 18 de agosto 2017 que cubre los aspectos básicos de R (variables, vectores, matrices, factores). | Descargar archivo |
| Capacitación_R_2.Rmd | Script del 25 de agost del 2017 que cubre los temas dataframes, lists, regresión lineal). | Descargar archivo |
| Ejercicios_1.R | Ejercicios para practicar. | Descargar archivo |